Датой основания факультета можно считать 1869 год, когда профессор А.И. Якобий организовал на медицинском факультете Императорского Казанского факультета первую в России кафедру общественной гигиены. В 1930 году вместе с получением медицинским факультетом статуса института создается санитарно-гигиенический факультет.

Медико-профилактический факультет проводит подготовку врачей-гигиенистов и эпидемиологов, в сферу деятельности которых входит оценка состояния здоровья человека и окружающей среды и проведение комплекса профилактических мероприятий. Выпускники медико-профилактического факультета получают специальную подготовку для работы в системе санитарного и эпидемиологического надзора. Срок обучения 6 лет.

В течение первых трех лет обучения осуществляется подготовка студентов по общеуниверситетской программе фундаментальных медико-биологических наук. С  четвертого курса, наряду с базовой клинической подготовкой, студенты изучают ряд специальных дисциплин гигиенического и профилактического профиля, позволяющих им на этапе преддипломной подготовки (шестой курс) специализироваться в области медицины труда и гигиены питания, эпидемиологии и других профильных дисциплин. 

Сотрудники факультета на протяжении многих лет успешно участвуют в выполнении научно-исследовательских работ по заказу крупных промышленных предприятий республики, различных министерств и ведомств в области коммунальной гигиены, гигиены и медицины труда, гигиены детей и подростков.