Мировая история не знает более тяжёлых испытаний, чем те, что выпали на долю нашего народа в Великую Отечественную войну. Наша республика в эти трудные годы стала одной из крупнейших тыловых баз по оказанию помощи раненым, восстановлению их здоровья. Сюда были эвакуированы почти в полном составе Минздрав СССР и Минздрав РСФСР, а также 42 медицинских вуза из разных городов Советского Союза. Казань в годы войны превратилась в один из крупнейших медицинских центров нашей страны.

Мы с благодарностью и гордостью вспоминаем преподавателей и студентов Казанского медицинского института, внесших своим трудом огромный вклад не только в разгром фашисткой Германии, но и в развитие отечественной медицины.

Хотя Татария являлась тыловым районом, глубокое вторжение фашистских захватчиков на территорию страны в 1941-1942 годах сделало реальной опасностью нападение противника с воздуха на промышленные и железнодорожные узлы республики. В конце сентября 1941 года, когда немецко-фашистские войска готовили удар по столице нашей Родины Москве, вражеские разведывательные самолеты начали появляться в непосредственной близости от границ ТАССР. По указаниям местных Советов были проведены работы по затемнению промышленных предприятий, учреждений, учебных заведений, жилых домов, по маскировке крупных промышленных объектов.

На территории ТАССР была развернута мощная сеть эвакогоспиталей, которая насчитывала 70 госпиталей. Только 1941-1942 г.г. в Казани было создано  45 госпиталей. Медики военных лет работали по 12-18 часов в сутки.

Большая роль в организации работы института в военные годы принадлежит видному деятелю советского здравоохранения, одному из первых выпускников КГМИ С.В.Курашову[1]. Незадолго до начала Великой Отечественной войны, 24 мая 1941 года, он был назначен директором Казанского медицинского института и оставался им до 25 марта 1942 г. В первые месяцы войны ему пришлось срочно перестраивать работу института, пересматривать программы и учебный процесс, ускорять обучение и выпуск врачей, готовых к работе в военных условиях. Производственную практику студенты стали проходить в эвакогоспиталях. Работа клинических кафедр была также перенесена в эвакогоспитали, в которые перешла работать часть преподавателей института. Направление исследований кафедр резко изменилось – почти вся тематика стала военной.

Много забот легло на плечи С.В. Курашова в связи с размещением эвакуированных из Москвы сотрудников Наркомздрава СССР и Наркомздрава РСФСР, организацией госпиталей в помещениях института[2]. Кроме того, пришлось организовывать выезды сотрудников института (преимущественно гигиенистов) для ликвидации возникавших очагов инфекции. В то же время С.В. Курашов продолжал работать  в Казанской психиатрической больнице, где одно отделение было отведено для приёма раненых и контуженных. Под госпитали также были заняты учебные здания институтов, школ, клиники медицинского института и ГИДУВа, больницы, студенческие общежития, гостиницы, клубы и другие здания. В госпиталях работали опытные специалисты: хирурги – И.В.Домрачев, зав. кафедрой факультетской и госпитальной хирургии педиатрического факультета в 1935-1960 гг., Б.Г.Герцберг, зав. кафедрой общей хирургии в 1936-1948 гг., Н.В.Соколов, зав. кафедрой топографической анатомии и оперативной хирургии в 1930-1933 гг., госпитальной хирургии в 1935-1963 гг., С.М.Алексеев, зав. кафедрой факультетской хирургии в 1935-1960 гг., И.Ф.Хоритонов, зав. кафедрой топографической анатомии и оперативной хирургии в 1949-1952 гг.; терапевты – А. Г. Терегулов, зав. кафедрой пропедевтики внутренних болезней в 1929-1944 гг., госпитальной терапии в 1944-1964 гг.,  З.И. Малкин, зав. кафедрой факультетской терапии в 1932-1969 гг., и кафедры внутренних болезней №2 в 1932 г.,; невропатологи – И. И. Русецкий,  Л.И.Омороков, зав. кафедрой нервных болезней в 1936-1967 гг.,; психиатры М.П.Андреев, зав. кафедрой психиатрии в 1933-1967 гг., ; рентгенолог М.И.Гольдштейн, зав. кафедры рентгенологии в 1936-1951 гг; фтизиатр Б.Л.Мазур,; инфекционисты – А.Ф.Агафонов, зав. кафедрой детских инфекций в1933-1946 гг., с 1943 по 1944 директор Центрального педиатрического института РСФСР; Б.А.Вольтер, зав. кафедрой инфекционных болезней в 1924-1956гг.; окулисты – В.Е.Адамюк, зав. кафедрой офтальмологии в 1929-1950 гг., сын одного из основоположников российской офтальмологии Е.В. Адамюка; А.И.Мурзин, зав. кафедрой офтальмологии в 1951-1954 гг.; отоларинголог Н.Н.Лозанов, зав. кафедрой оториноларингологии в 1939-1967 гг. и другие. Большую помощь госпиталям оказали хирург, Заслуженный деятель науки РСФСР, профессор А.В.Вишневский, главный терапевт отдела эвакогоспиталей Татнаркомздрава, профессор В.И.Катеров; главный хирург, профессор Л.И.Шулутко. Но всё внимание института и его директора было обращено на ускоренное обучение студентов. Студентам медицинского института приходилось переносить все тяготы войны. Учебный год начинался с 1 августа. Студенты занимались по 8 часов в день, а затем шли работать в эвакогоспитали помогать раненым. Питались они очень плохо. Но, несмотря на все трудности, они находили в себе силы заниматься еще и научной работой. Именно в годы войны в 1943 году в Казанском мединституте была возобновлена работа студенческого научного общества. Однако, молодых врачей прежде всего готовили для работы на фронте. Из каждой кафедры института было мобилизовано в армию от 2 до 9 преподавателей. Всего за годы Великой Отечественной войны институт сделал 6 выпусков врачей, в том числе 3 (из них 2 досрочных) – в 1941 году. В этом году было подготовлено свыше 900 врачей, из которых более половины были мобилизованы в армию. Вчерашние студенты стали солдатами. Многому им пришлось учиться. И они научились рыть окопы и разворачивать медицинские пункты, выносить раненых с поля боя и сутками стоять у операционных и перевязочных столов, работая при свете коптилок. И, вырвав у смерти человеческую жизнь, они с благодарностью вспоминали своих преподавателей, передавших им свой богатый опыт. А сколько раз, отложив медицинские инструменты, они защищали раненых с оружием в руках. Кроме того, за годы войны в республике было подготовлено около 3,5 тысяч медсестер и свыше 3 тысяч сандружинниц. В 1942 году С.В. Курашов покидает Казань и переезжает в Москву в связи с назначением заместителя Народного комиссара здравоохранения РСФСР[3].

Профессора и преподаватели медицинских вузов выдвигались на руководящие должности. Начальниками госпиталей или отделений работали доценты В.Н.Мурат, М.А.Ерзин. Только за 1941-1943 г.г. коллективом кафедры госпитальной хирургии (зав. кафедрой, проф. Н.В.Соколов) сделано свыше 6600 операций и проведен курс лечения более 9 тысяч больным. В течение всей войны не менее 4 часов в день в госпиталях работали профессора-клиницисты, хирурги И.В.Домрачев, Б.Г.Герцберг, Н.В.Соколов, невропатолог И.И.Русецкий.  В госпиталях,  институтах, лабораториях велось изучение характера ранений, изыскивались новые, более совершенные методы лечения ран.

В годы войны казанскими хирургами было сделано огромное количество сложнейших операций, спасших жизнь сотням тысяч раненых. Особенно следует выделить успехи пластической хирургии. Е.А.Домрачева[4] смогла помочь, в буквальном смысле, сохранить лицо многим нашим воинам, изуродованным тяжелыми ранениями. Ее операции по применению Филатовского стебля были уникальны, и опередили развитие мировой пластической хирургии на 20 лет.

Во время Великой Отечественной войны преподаватели и сотрудники многих других кафедр КГМИ внесли большой вклад в развитие науки. Примером тому является работа кафедры биологии. Темы научных работ были максимально приближены к нуждам военного времени. По заданию Фармакологического Комитета Минздрава СССР сотрудники кафедры под руководством заведующего, профессора Всеволода Владимировича Изосимова[5] работали над проблемой "Борьба с переносчиками инфекции", изучали способы профилактических мероприятий против педикулеза, способствующего распространению сыпного тифа. Ассистенты И.Н.Молчанова, О.А.Тихомирнова, лаборант Ф.Т.Туйст изучали действие различных инсектицидов – анабазива, чемерицы на вшей. Они установили, что в комбинации с мылом возрастают инсектицидные свойства керосина. По этой проблеме было опубликовало 4 статьи, результаты исследования были доложены на заседании Фармакологического Комитета. Данное исследование имело большое практическое значение.

В 1943 г. ассистент О.К.Элпидина занималась исследованием гриба Fusarium sporotrichiella, вызывающего септическую ангину, распространившуюся в годы войны. Дальнейшее изучение биологических свойств антибиотика поина, получаемого из гриба Fusarium sporotrichiella var poae, показало в условиях эксперимента на животных его ценные антибластомные свойства.

По предложению Академии наук СССР сотрудники кафедры включились в разработку еще одной важной для того времени проблемы "Изыскания пищевых ресурсов". Проводилась оценка различных белковых веществ, определялась возможность использования их в пищу. Была изучена зараженность диких и домашних животных трихинеллезом и описторхозом. Результат исследования опубликован в 2 тезисах.

Трудно переоценить заслуги сотрудников кафедры биологии при предотвращении или быстрой ликвидации вспышек инфекционных заболеваний в Казани во время Великой Отечественной войны. Сотрудник кафедры Ф.Ф.Муртази[6] явился ярким тому примером. Он заведовал рентгенологическим отделением эвакуационного госпиталя №2778, которое размещалось в старой клинике и обслуживало 3 рентгенологических кабинета. С 1942 г. по 1945 г. Ф.Ф. Муртази работал заведующим здравотделом Свердловского района гор. Казани. Организационные способности Фарида Фатыховича проявились особенно ярко; в трудных условиях 1942 года медики района в течение месяца ликвидировали вспышку сыпного тифа в г. Казани, была организована работа пропускных дезинфекционных пунктов, через которые проходили все пребывающие в Казань эвакуированные, организовали их питание, обеспечили жильем.

За самоотверженный труд в годы Великой Отечественной войны все сотрудники кафедры были удостоены почетной медали "За труд в Великой Отечественной войне".

С.В. Курашов после окончания Великой Отечественной войны сделал блестящую карьеру как организатор здравоохранения. В 1946 году (до 1951 г.) его назначают начальником Главного курортного управления и он становится членом коллегии Министерства здравоохранения. Затем начальником Главного управления учебными заведениями Минздрава СССР, с 1953 г. заместителем Министра здравоохранения СССР; с 1955 г. он становится Министром  здравоохранения РСФСР и заведующим кафедрой  здравоохранения в 1-м Московском медицинском институте им. И.М.Сеченова, а в 1959 г. Его назначают Министром здравоохранения СССР[7]. С. В. Курашов был широко известен за рубежом. Он заложил первый камень в фундамент Всемирной организации здравоохранения. Он достойно представлял нашу страну на международном уровне. И после его смерти Казанскому государственному медицинскому институту было присвоено имя  С. В. Курашова.