Уважаемые студенты!

Ликвидация задолженностей по модулям и практическим занятиям согласно графику работы компьютерного класса. График размещен на кафедре.

Метод Slide-seq создает карты клеточных взаимоотношений в тканях с высоким разрешением без использования микроскопа. Новая методика, разработанная учеными из Института им. Броада в Массачусетском технологическом институте и Гарварде, дает беспрецедентное представление о клеточной организации тканей. Этот метод, известный как Slide-seq, использует генетическое секвенирование для построения подробных трехмерных карт тканей, показывающих не только разнообразие типов клеток, но и то, где они расположены и какие функции выполняют.

Трехмерная реконструкция девяти кубических миллиметров гиппокампа мыши, 

профилированных с помощью Slide-seq (цвета обозначают разные типы клеток)

© Macosko/Chen labs

Поскольку в данном случае не требуется специализированное оборудование для визуализации, эта технология может использоваться учеными в различных областях биологии, генетики и медицины, которые хотят посмотреть на клеточную структуру тканей или наблюдать, где конкретно в ткани, органе или даже целом организме действуют определенные гены.

Такая платформа предлагает беспрецедентные представления о клеточной структуре тканей, о роли, которую играют гены в различных тканях, а также о последствиях травм или других возмущений для ткани, предоставляя исследователям богатые схемы функций тканей.

Техника начинается с покрытого резиной предметного стекла или «шайбы», которая заполнена микрочастицами, или «бусинками», с уникальными штрих-кодами ДНК. Ученые последовательно генерировали данные, которые позже позволяют пользователям определять, откуда происходит чтение последовательности в массиве «бусинок».

Чтобы продемонстрировать возможности инструмента, команда использовала Slide-seq для локализации типов клеток в мозжечке и гиппокампе в мозге мыши, выделяя подробные структуры, включая слой клеток толщиной в одну клетку. Применив Slide-seq к срезам мозжечка мыши, команда выявила полосы изменения активности генов в ткани, паттерны, которые указывают пространственно определенные субпопуляции, которые не были обнаружены при использовании традиционного метода секвенирования отдельных клеток.

Исследователи также продемонстрировали, что наложение ряда кусочков ткани может выявить трехмерную организацию ткани и клеточную функцию, генерируя анимированную трехмерную реконструкцию гиппокампа мыши, которую можно настраивать для отображения различных типов клеток или экспрессии отдельных генов.

Статья опубликована в журнале Science

Источник: scientificrussia.ru

Ученые института Солка обнаружили, что моторные нейроны получают множество сигналов, чтобы успешно перемещаться к месту назначения в организме, — пишет eurekalert.org со ссылкой на Neuron.

Моторные нейроны (зеленые) выходят из спинного мозга (красные) и входят в периферию тела, чтобы соединиться с мышцами. Справа: двигательные нейроны (белая стрелка) без мутации p190 находятся внутри спинного мозга.

© Salk Institute

 «В нервной системе насчитывается 100 триллионов соединений, управляемых 20 000 генов, из которых, как известно, примерно 10 семейств генов участвуют в управлении аксоном. Мы хотели понять, какие умные генетические системы используются природой для подключения самой сложной биологической машины во Вселенной, — говорит профессор Солка Сэмюэль Пфафф — старший автор и исследователь Медицинского института Говарда Хьюза. — Таким образом, мы решили исследовать, как моторные нейроны находят свои связи с мышцами в теле, что очень важно для нашего мозга в деле передачи информации нашим мышцам для обеспечения движения».

При более тщательном изучении исследователи обнаружили, что двигательные нейроны поднимаются по краю спинного мозга, а не выходят должным образом для достижения своих целей в мышцах. Команда определила ген, отсутствие которого вызывает эту вредную мутацию — p190, который, как ранее было известно, играет роль в подавлении рака.

Исследователи организовали серию экспериментов, чтобы изучить, как p190 влияет на аксоны, покидающие спинной мозг. Они обнаружили, что, хотя аксоны обычно притягиваются к белку в спинном мозге, называемому нетрином, в течение короткого промежутка времени p190 действует как ослепляющий фактор, поэтому аксоны игнорируют нетрин и выводятся за пределы спинного мозга. Без p190 аксоны притягиваются к нетрину и не покидают спинной мозг должным образом, поэтому никогда не соединяются с мышцами.

Пфафф — руководитель кафедры Бенджамина Х. Льюиса — добавляет: «Эти результаты обеспечивают понимание невообразимой сложности, которая характеризует общение клеток друг с другом».

Статья опубликована в журнале Neuron

Источник: scientificrussia.ru

Просим Вас ознакомится с 3 модулем "Медицинская генетика" на образовательном портале для подготовки к тестовой части.

Ген blaNDM-1, делающий бактерии невосприимчивыми к антибиотикам, добрался до Арктики. К такому выводу пришли учёные из Ньюкаслского и Йоркского университетов (Великобритания), Университета Канзаса (США) и Китайской академии наук.

В 2013 году исследователи собрали 40 образцов почвы из восьми мест в районе Конгс-фьорд (побережье острова Западный Шпицберген). На протяжении следующих лет специалисты выделяли из них ДНК и анализировали. В результате учёные нашли в пробах почвы 131 ген, делающий бактерии невосприимчивыми к антибиотикам.

«Обнаруженные гены делают бактерии устойчивыми к девяти основным классам антибиотиков, включая аминогликозиды, макролиды и бета-лактамы, которые используются для лечения многих инфекций. ... Ген blaNDM-1 был обнаружен в более чем 60% образцов почвы», — сообщил автор исследования Дэвид Грэм.

Бактерии, несущие ген blaNDM-1, невосприимчивы практически ко всем бета-лактамам — наиболее многочисленной и распространённой группе антибиотиков. Штаммы с blaNDM-1 учёные впервые обнаружили в клинических условиях в 2008 году. В 2010-м они были обнаружены в Индии. С тех пор blaNDM-1 был найден в более чем 100 странах, включая азиатские и европейские, а также США.

Специалисты встревожены высокой скоростью «передвижения» гена blaNDM-1 и бактерий, которые его несут.

Учёные не могут с уверенностью сказать, как «ген супербактерии» оказался в Арктике. По их мнению, blaNDM-1 мог попасть на Западный Шпицберген вместе с перелётными птицами либо с немногочисленными посетителями острова. Учёные добавили, что, пока ген находится в почве, он не представляет опасности для людей. Однако необходимо следить за его дальнейшим «передвижением».

«Из-за общемирового злоупотребления антибиотиками, ... загрязнения питьевой воды темпы эволюции (бактерий. — RT) ускорились и появилось целое семейство устойчивых штаммов, которых раньше никогда не было», — объяснил Грэм.

По мнению исследователей, «единственный способ победить в этой борьбе — изучить все пути, ведущие к развитию у бактерий резистентности к антибиотикам».